Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc4Q9ES56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms