Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trhr2Q9ERT2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trhr2Q9ERT2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms