Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms