Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dap3Q9ER88 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms