Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clstn2Q9ER65 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms