Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn12Q9ER56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn12Q9ER56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms