Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms