Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pold3Q9EQ28 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold3Q9EQ28 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms