Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl4Q9DCU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms