Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufs3Q9DCT2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufs3Q9DCT2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms