Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn3Q9DCB1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms