Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms