Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cbx6Q9DBY5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms