Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms