Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riok3Q9DBU3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms