Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm9sf1Q9DBU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm9sf1Q9DBU0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms