Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrpraQ9DBG7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrpraQ9DBG7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms