Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB76

Emc9, ER membrane protein complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc9Q9DB76 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emc9Q9DB76 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc9Q9DB76 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc9Q9DB76 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc9Q9DB76 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc9Q9DB76 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emc9Q9DB76 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms