Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5oQ9DB20 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5oQ9DB20 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms