Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd8Q9DA37 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd8Q9DA37 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms