Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhc1Q9D9T8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms