Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9D9S1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms