Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9H8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms