Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx5Q9D8U8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms