Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med11Q9D8C6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med11Q9D8C6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms