Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms