Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1Q9D883 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms