Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timm50Q9D880 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms