Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slx4ipQ9D7Y9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slx4ipQ9D7Y9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slx4ipQ9D7Y9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slx4ipQ9D7Y9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms