Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clic3Q9D7P7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Clic3Q9D7P7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Clic3Q9D7P7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clic3Q9D7P7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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