Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms