Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa5Q9D7I0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shisa5Q9D7I0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms