Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7G0

Prps1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1Q9D7G0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prps1Q9D7G0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prps1Q9D7G0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms