Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp4cQ9D7F7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms