Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms