Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl8cQ9D6I0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl8cQ9D6I0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rtl8cQ9D6I0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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