Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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