Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930578G10RikQ9D4Q4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms