Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms