Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf6Q9D4J7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms