Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms