Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clvs1Q9D4C9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clvs1Q9D4C9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms