Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms