Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms