Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc71Q9D3W5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc71Q9D3W5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms