Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph14Q9D3W1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph14Q9D3W1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms