Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms