Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1cQ9D300 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms