Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsig1Q9D2J4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms