Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms